巴内尔被迫撤退，于5月抵达哈尔伯施塔特，并在此死去。尽管6月在沃尔芬比特尔击败了一支帝国军队，但他的大部分德意志军队因缺乏薪水而叛变。
11月连纳特·托斯滕森带着7000名瑞典新兵和足够的现金来满足叛乱分子的到来挽救了局面。
法国于1642年1月在肯彭取得胜利，随后在1642年10月布莱登菲尔德战役中，托尔斯滕森对由奥地利大公利奥波德·威廉率领的帝国军队造成近人伤亡。
12月对莱比锡的占领使瑞典人在德意志有了一个重要的新基地，尽管他们未能占领弗赖堡，到1643年，撒克逊军队已被缩减为几个孤立的驻军。
斐迪南承认他不能再通过军事手段实现自己的目标，但希望通过继续战斗来阻止帝国加入与法国和瑞典的谈判，让他个人代表整个帝国。丹麦受其所制，因此乘瑞典军进攻日耳曼南方之际，向瑞典宣战。
丹麦曾于1644年击败瑞典与荷兰的联合舰队，但其后丹麦海军却被重新组建的瑞荷联合舰队全歼。在经过三年（1643年－1645年）战争后，瑞典军成功从水陆两路进逼丹麦，逼使丹麦停战求和。
黎塞留于1642年12月去世，随后路易十三于1643年5月14日去世，留下他五岁的儿子路易十四为国王，这似乎让停战更容易实现。然而，黎塞留的政策由他的继任者红衣主教马萨林延续，而法国在阿尔萨斯的胜利使他能够重新专注于在荷兰对西班牙的战争。
5月19日，孔代在罗克鲁瓦战役大胜西班牙人。尽管他的成功没有人们通常认为的那么重要，由于它对西班牙对荷兰南部的控制没有立即影响，而且在罗克罗伊被俘的西班牙退伍军人很快被交换，它结束了从低地发动另一次入侵法国的所有机会。
孔代无法充分利用罗克鲁瓦战役的部分原因是影响所有战斗人员的因素。25年战争造成的破坏意味着军队在觅食上花费的时间多于战斗，这迫使他们变得更小、更具机动性，并且更加重视骑兵。
它还缩短了竞选季节，因为收集草料的需要意味着他们开始较晚，并将它们限制在容易供应的地区，通常靠近河流。
此外，法国人在11月在图特林根被弗朗茨·冯·梅西率领的巴伐利亚帝国军队摧毁后，不得不在德意志重建军队。
在罗克鲁瓦战役之后不久，斐迪南邀请瑞典和法国参加威斯特伐利亚城镇明斯特和奥斯纳布吕克的和谈，但当丹麦的克里斯蒂安封锁汉堡并增加波罗的海的通行费时，这些谈判被推迟了。
这严重影响了荷兰和瑞典的经济，1643年12月，瑞典人通过入侵日德兰半岛开始了托斯滕森战争，荷兰人提供了海军支持。
斐迪南召集了一支由加拉斯率领的帝国军队从后方攻击瑞典人，这是一个灾难性的决定。1644年5月，托尔斯滕森离开弗兰格尔完成丹麦战争，进军帝国。
加拉斯无法阻止他，而丹麦人在1644年10月在费马恩战败后寻求和平。
1644年8月，法国和巴伐利亚军队在为期三天的弗莱堡战役中相遇，双方伤亡惨重，但通常被视为巴伐利亚的微弱胜利。
他的损失使马克西米利安确信这场战争无法再获胜，他现在向斐迪南施加压力以结束冲突。11月和谈重启后不久，加拉斯的帝国军队解体，残馀部队撤退到波希米亚，1645年3月，他们在扬考被托尔斯滕森分散。
5月，弗朗茨·冯·梅西领导的巴伐利亚军队在赫布斯豪森摧毁了一支法国分遣队，随后他于8月在第二次纳德林根战役被击败并被杀。
由于斐迪南无法提供帮助，萨克森的约翰·格奥尔格于9月与瑞典签署了为期六个月的休战协议，随后于1646年3月签订了欧伦堡条约，在该条约中他同意在战争结束前保持中立。