摄政四年春，吴芮受封越公，加宣武大将军，食邑三万户。
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天下平定后，吴芮的晚年很充实，他利用这几年休养生息的时间做了一件大善事。
在吴芮的主持下，由他改善的水稻品种在南方迅速发展，最初是临江地区，实验成功后被推广至西楚、南楚之地，直至闽中、赣中和两广地区，一年过后增产近半！
这种水稻被称为“芮稻”，比之先前的水稻品种成熟期更短，产量更高，且配合南方特有的曲辕犁，对耕种条件要求较小，在短短五年的时间里让南方诸郡摆脱了缺粮困境，成为反哺中原地区的粮仓。
在之后的数十年里，跟随吴芮实验的力田、司农们不断改良“芮稻”品种，还开发出鱼稻混养的模式，让南方从北人闻之色变的瘴气之地变成享誉中原的鱼米之乡。
诸越也由此从山林中走出，开垦水田，兴建聚落，江南的繁荣气象初现端倪。
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摄政九年，久卧病榻的吴芮去世。
江南，百余越人君长冒雨送行，嚎哭不止，哀悼白绫七月不撤。
吴芮比历史上多活了半年时间，他死于寄生虫病。
虽然黑夫在南方曾开展过提倡饮沸水、建立公厕、不赤足入水田等卫生行动，但南方盛行的寄生虫病依旧是夺人性命的头号祸首。
吴芮死后，黑夫命人统计他在南方的功绩，经过博士讨论后，黑夫亲自选取了吴芮的谥号。
史载，摄政九年冬，咸阳谥吴芮为越庄公，享受超过彻侯，比肩王公的礼仪安葬咸阳，立越君、鄱君的形象入南方诸郡靖边寺、土地庙，世受香火供奉！
张苍在书中对吴芮的评价如下：
吴芮虽蛮夷出身，知礼义廉耻却尤甚中原士人。
吴芮在诸夏与诸越民族相融中起到了积极促进的作用，在他的推波助澜下，夏秦越人在接受诸夏文明影响后，从屡叛不止的刁民变为夏秦治下骁勇善战的国人，江南大治。
兴义兵、明正统、良稻种。
此三功福泽当代，利在千秋。
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后记：长子吴臣传见后文。
次子吴郢袭爵干越候，居咸阳三年为郎中令，后统镇闽中，贯彻吴芮时的亲夏政策，因有乃父之风而被称为“小越君”。