直系军队也没闲着，也得到一个番号，编成直军13师。不过他们就没有奉系这么爽了：几天的大战，他们交火最猛，伤亡也最重，被接收的皖军都是被打惨了的。相比较于奉军的除了一个旅长被俘外伤亡无几的战损，他们觉得所得与承担了击败皖军的重任不符。
张作霖完全没想到战争会如此顺利，凭心而论，奉军出力并不多，所以在要求分割军队上底气不足。不过这一点并不以成为他的怯场之举，反而变成他在政治上讨价还价的本钱。
他决定暂且“搁置争议，共同受降”，先把重要的后皖系时代的政治局面稳定住，这一点得到曹锟的赞同。正准备享受胜利果实的时候，他也不想与张作霖翻脸。
于是两人转手讨论内阁的组成。不约而同地，他们都主动“退居二线”，表现出这个时代军阀难得的高风亮节。不过在安排代理人角色上，却又流露出悲天悯人的情怀，为国争贤绝不退让。
总统任期还没结束，而且总统按照民国法律是由国会选举出来的，所以暂时不能动。
内阁其实是民国政治的核心，总理这一重要位置自从段祺瑞坐过之后就显得十分拉风。在这个时候，与各方都有重大交情的靳云鹏光芒四射，被一致推举为新总理后，双方的焦点但落在阁员名单上来。
那时的民国中|央政|府高级官员还是很少的，不像后世动辄几十个大部做起事来还照应不周，人家真的是小政|府大社会。通共九个部，照料到国家生活的重大方面。
能够接任各部总长的，都是当时中|央里面有数的几位能人，很多人都是经历了几朝的职业官僚。双方最没有意见的是拟担任外交总长的颜惠庆、拟担任教育总长的范源濂、拟担任司法总长的董康，对于内务、财务、农商、交通、陆军等几部，都有争执。
在这几个位置中，奉系最看中的是农商和财务，其次是交通，而曹锟最看中的则是陆军、海军、内务几个要害部门。
因为入京前，奉系大员作了充分的讨论，大家认为，此时奉系并没有做好全盘接手中|央的准备，贸然下手，现在内忧外患会都转移到奉系身上，看起来光鲜无比，其实得不偿失。
内忧，是皖系蜇伏、南方国民党步步紧逼、直奉两派堪成对手；外患，是英美日都分别加紧了代理人的战争，作为日本“天然”的盟友，张作霖只能勉强保住自己的一亩三分地，如果入主北洋，除非甘愿作汉奸，否则必须冒着和日本人翻脸的风险。在台下可以发表发表意见作作愤青，但执掌权柄后，很多事便不能做得太激进。
而直系有英美作后盾，对日本人的要求可以有适当的反抗，这是人家的优势所在。这是他们敢于争一争政权主导性的底气所在，所以，管警察的内务部、海军和陆军，都是他们的目标。所以奉系骨干认为，目前还是埋头发展的好。农商和财务，与东北经济颇有互补性，需要一搏。
按照一比一的比例，双方又妥协了四个总长，张作霖需要直系在内务等三个职务中选两个。
考虑到海军例来自成一系，萨镇冰在海军及至政|府中的影响力巨大，这一块直系决定不去伸手；但当准备自行决定陆军总长人选时，靳云鹏不干了。
几任总理中，除了兼任陆军总长的段祺瑞干得较久外，其他的总理都是走马灯似地换，作为民国元老的靳云鹏不会不知道，所以他坚持要兼任陆军总长，否则，他宁可不干。
总长可以协商着解决，总理只有一个，非彼即此，要换一个像靳云鹏这样在直奉系内都有强烈支持的人选还真难找。为了不添加麻烦和变数，尽早解决中|央的混乱，曹锟决定妥协。
剩下一个交通总长的人选，大总统徐世昌提名叶恭绰。考虑到交通系在政|府中的影响，双方都同意了。
于是，在看起来友好的气氛中最终决定了组成靳云鹏内阁，它的名单是直奉两系相互妥协的产物：9位阁员中，张志谭为直系，王乃斌属奉系，靳亲近奉系，周、叶均为交通系人物而接近奉系，还有一个萨镇冰对张汉卿的印象十分之好。
奉系控制着重要的交通和财政大权，在内阁中居于有利地位，大体上看来靳内阁逐渐倒向张作霖一边，这使曹锟、吴佩孚十分不满。