这一战金军一共损失了大小战船一百三十三艘，其中有包括旗舰在内的大型楼船四艘，两千料中型楼船十八艘，一千料战船六十五艘，还有六十多艘战船，受了不同程度的伤损，需要修理。战死士兵六千余人，另有三千多名伤兵。
抹然史乞塔这才知道宋军水战的厉害，怪不得金军历来在水上都找不到宋军多少便宜，从此之后再也不敢小视宋朝的水军。立刻下令紧闭寨门，严加防守，不敢再出战了。一心兄等着庆元府的援军赶来，合力对付宋军。
宋军得胜之后,并没有进攻三门湾的金军水寨,而是回到东箕列岛的驻地停汨，毕再遇下令全军欢庆。不过在查点战船之后，李公佐却有些笑不出来，这一战中宋军居然也被金军击沉了四十二艘大小战船，包括三艘两千料战船，十七艘一千料战船。阵亡将士一千余人，还有二十多艘战船受伤,暂时失去了战斗力，因为宋军远离自己的水寨，人手工具都不齐全，因此伤船之中，恐怕有一半都难以修好。
虽然宋军的损失只相当于金军的三分之一左右，但除了此前的东海一战,是因为众寡实在太过悬殊之外，大宋水军还从来没有过在那一次与金军的战斗中,会损失这样多的战船。无论是当年的陈家岛之战,还是后来的福山岛之战，金军的损失至少都过了宋军五倍。
而且从战事的进程来看，如果不是因为这一战宋军有铁甲船，或者如果不是因为铁甲船的突袭，击毁了金军的旗舰，那么就算这一战宋军依然能够获胜，但付出的伤亡还将会更大。
由此可见，在这一次南侵中，金军的水战能力确实有了长足的进步，因此选择从海上突势大宋，说明这几年来金军在花大力训练水军。虽然目前金军的水战还不足以赶上宋军，但以经不容小视了。
而且海上第一战虽然是胜了，但现在金军的战船还是远多于宋军，而且宋军又是远离自己的水军基地作战，再后面的战斗中，如果稍有不慎，只怕就会令宋军陷入困境。因此李公佐暗暗提醒自己，绝对不能因为初战告捷而放轻警惕，后面的战斗必须要计划周详。
好在这一战中，宋军一共俘虏了金军大小战船三十五艘，其中有二十二艘都基本完好无损，可以立即编入宋军的船队中使用，俘虏的战船中，有二艘是两千料战船，有十四艘都是一千料战船。这样一来宋军实际的损失并没有表面上那样大，总体的战斗力也基本没有受到多大的影响。
随后几天，金军都不敢出战。李公佐知道他们是在等待庆元府的援军，因此也没有去强攻金军的水寨，只是停泊在东箕列岛中，一面重新整编新的战船编制，一面又命人抓紧抢修受伤的战船。又派人去催促后勤船队，赶快赶到，同时也派人严密监视兴元府金军水军的动景，准备迎接下一次大战。
就这样双方罢战了数天之后，李公佐和抹然史乞塔几乎时同时接到消息，金国的水军都统制苏保衡率领着金军的援助船队，以经接近了三门湾海域。
苏保衡出任金国的水军都统制多年，早在大定初年（1161年）的陈家岛海战起，就开始和宋朝的水军打交道了。他可是深知宋朝水军的厉害，也知道东海一战，金军其实是以多胜少，而且还是惨胜，并不表示大金的水军从此就能和宋朝相抗了，因此他始终都保持着谨慎小心的态度，和在此之前抹然史乞塔的盲目乐观自信可截然不同。
在接到了抹然史乞塔的求援之后，苏保衡立刻意识到，这一次宋朝水军绝不会是小打小闹。因为他对当前战局的认识比抹然史乞塔要清楚得多，现在宋朝夺取了淮西，取得了战场上的主动权，各条战线的金军都被迫退较为防守，宋朝没有理由在最具有优势的水军上还一直按兵不动。因此宋朝的水军不来则矣，一来必然是以雷霆万钧之势，直击大金的水军。
因此虽然水军的其他战将都认为，既然这一次进攻三门湾的宋军战船不多，那么庆元府也只需要出动一部份战船去援助抹然史乞塔就够了，但苏保衡仍然决定，一定要将庆元府所有的五百二十余战船，和夹谷、兀里坦达、鲁仲雄、毕芮、慕容颜达等水军将领全部带出来，支援三门湾。
因为苏保衡认为，虽然宋军只出动两百多艘战船，但这一定只是先头船队，宋军主力船队一定会跟在后面，为了以防万一，必须动用足够多的战船，先将宋军的先头船队击败，然后再迎战宋军的主力。
而李公佐接报之后,也吃了一惊,他原以为自己分兵之后，金军一定不会太在意，庆元府那一边最多只会出动两百艘左右的战船来支援三门岛,这样金军的船队相加，最多也不会过六百艘。而宋军的战船总数按近五百艘，双方差距不大，而且宋军前后夹击，就可以轻松击败金军。
但李公佐却没想到苏保衡竟会倾剿而出，将庆元府的五百多艘战船全部带出来了。这就几乎等于是宋金两国的水军提前开始决战。那么这一战可就关系重大了，绝不能轻易对待。
现在和三门湾的金国水军相加，金军战船的总数接近八百艘。几乎是宋军的一倍。而刚刚和金军打过一仗之后，金军水战的能力明显提高，面对远多于自己的敌军，那么自己在战前制定的前后夹击之计是否还能有效，这时李公佐心里也没有绝对的把握了。
因为水战不同于6战，即使是有伏兵，也不可能像在6地上那样，突然杀出，打对手一措手不及。以金军有足够的战船，能够对付这样两线作战。因此李公左认为自己的作战计划有必要重新制订一下了。
在行军的途中，苏保衡接到了抹然史乞塔初战失败的消息，也大吃一惊，怕宋军乘势进攻三门湾水寨。当下急忙催促船队加快度，赶到三门湾。好在这一段时间里，宋军并没来进攻金军的水寨，现在得知援军到了，也使抹然史乞塔一值提着的心终于放了下来。立刻也率领剩下的船队驶出三门湾，和苏保衡汇合。
两人碰面之后，苏保衡才知道这一段时间以来，宋军一直都没有动静。两人商议了一下，都认为宋军现在按兵不动，一定是再等待着主力船队赶到，集中兵力之后再和金军决战。因此两人一至决定，集中所有战船，主动去进攻宋军，就算不能将其全歼，也要重创宋军，挫一挫宋军的威风，同时也鼓一鼓大金小军的士气。
商议决定之后，金军立刻开始行动，将战船分为三路，从东、北、西三个方向进攻停驻在东箕列岛中的宋军船队。
那知金军的大军杀到之后，宋军见金军势大，并没有拼死抵抗，只是稍稍接触了一下之后，立刻就向南败退下去。
苏保衡和抹然史乞塔一见，估计宋军这是要退回南方去与主力船队汇合，因此下令追击宋军，希望趁着宋军还没有和主力汇合之前，消灭这支船队，那怕不能全歼，也尽可能多消灭几艘宋军的战船，削弱宋军的实力。
不过宋军虽退，但却是退而不乱，队尾始终和金军的队头若离若弃，如果有金军的战船追得过于靠前了，还时不时转过头来，给金军迎头一个痛击，而且宋军转头迎战的战船都是操纵十分灵巧，转向非常快捷。一但等金军的大队赶到时，又立刻转头就逃。
有好几次金军打算从两翼包操上去，截断宋军的后队，但都在最后关头，被宋军逃脱了。