随着塔上不时变化的旗语和号令，守军也不断的据此调整着射击，持续向城外倾泻火力，打击攻城的太平军。
太平军就这样围攻常熟，连续超过了一个多月，伤亡逾万，常熟依旧在坚守。直到李秀成离开东征前线，黄文金也随之离开，太平军的攻势才略放缓些。
围攻常熟的太平军，伤亡巨大，城中的守军消耗也不小。之所以能坚持下来，全靠战前城中的物资储备。从城外输送的补给，也发挥了重要的作用。
因为常熟城外水系稠密，太平军的包围也只是相对的。常熟仍可借助水路，与外界保持一定的交通。太平军为此也曾想尽办法试图阻断，但都被商团的武装运输冲破。
在这些军事行动中，商团甚至还得到了长江口中，洋人军舰的炮火支援。这也是陈济怀能接受的，洋人参战的最大限度。
李秀成离开后，商团的压力减轻了许多。苏州尚好些，但常熟仍在太平军的包围之中。缓转余地较小，不容有失。为了改善战场局面，略腾出手来的陈济怀，便开始布置对常熟的救援。
他计划，再次派出驻昆山的第七团第二十六营，从南线攻击围城的太平军。目的是削弱对方的实力，并吸引其注意力。随后由商团第八团的第二十七营，趁机从其他方向进入常熟，增加守军的力量。
在具体实施中，这个计划执行得很成功。两路商团都如期完成了各自的任务，同时击溃了数千太平军。常熟的压力也因此缓解了不少。
就在陈济怀为此有些小得意的时候，一个坏消息紧接着传来。原来第二十六营出击常熟，造成了昆山的空虚。太平军不知怎么侦知了这个情况，一支数千人的队伍插了过来，袭向昆山城。
昆山此时几乎就是一座空城，零星的守军见无法抵御，只得弃守。好在临撤出前，将城中堆积的弹药、粮草等物资付之一炬，未被太平军获得。
消息传来，陈济怀十分惊惧。昆山是苏州和常熟的侧后要地，如今丢失等于后路被断。同时昆山也是商团的创立之地，商团的第一个营地就建在那里，有很深的意义。
陈济怀对昆山的丢失，很是自责。他怪自己在指挥调度上，还是太过轻率，竟出如此纰漏。
他急命第二十六营，加速回返。又令第七团第二十四营，从太仓出击。令新组建的第三十四营，从松江北上。三路围攻，夺回昆山。
袭占昆山的太平军，立足未稳，又未能得到补给。人数也不占优的他们，在商团的围攻下，很快就被击溃。昆山也又重新被商团夺回。但物资损失确实很大，需要重新补充。
昆山失而复得，让陈济怀勉强松了一口气。他也提醒自己，今后要更加谨慎的对待战事，决不能再犯如此错误。
他就这样心力交瘁的度过了咸丰十年。苏南的局面虽有改观，但面对十数万太平军，压力依旧。
继续坚守的同时，他也期盼着不知何时才能到来的增援，望眼欲穿。